В новом С9 будет шасси из углеродного волокна, изготовленная из алюминиевых сплавов подвеска, специально разработанные шины Pirelli, специально для Pagani разработанная электроника Bosch и оригинальная выпускная система, которая позволит Zonda соответствовать самым жестким требованиям по токсичности выхлопа и соответственно Pagani сможет продаваться по всему миру.

Внешность автомобиля будет выполнена в стиле предыдущих Zonda, но будет значительно доработана. На С9 появятся двери, как у Mercedes SLS. Было убрано большое заднее антикрыло, большие прямоугольные задние фонари были заменены небольшими круглыми фонарями и были перемещены вверх. Граненая решетка воздухозаборника была заменена более скругленной. Классическое расположение наконечников выхлопных труб осталось прежним.